YKI Cabang Koordinator Daerah Istimewa Yogyakarta berdiri pada tanggal 21 Desember 1987. Di Daerah Istimewa Yogyakarta ada 6 YKI Cabang yaitu :
YKI Cabang Koordinator DIY
YKI Cabang Kota Yogyakarta
YKI Cabang Kabupaten Bantul
YKI Cabang Kabupaten Sleman
YKI Cabang Kabupaten Kulon Progo
YKI Cabang Kabupaten Gunung Kidul
Paguyuban Relawan Kanker
Paguyuban Pasien & Mantan Pasien Kanker
Paguyuban Orang Tua Kanker Anak
Indonesian Ostomy Association